摘要:采用iTRAQ结合2D LC-MS/MS技术对2年、3年和5年蛙龄的哈蟆油进行蛋白质组学研究,建立不同蛙龄哈蟆油的蛋白质组数据库。通过比较3年与2年,5年与3年的哈蟆油蛋白质数据,筛选出与年龄相关的差异表达蛋白质,应用生物信息学对差异蛋白进行GO注释和KEGG代谢通路分析。3个蛙龄的哈蟆油中质谱共鉴定蛋白质4493个,筛选得到不同蛙龄哈蟆油差异表达的蛋白质共28个,其中2年至5年哈蟆油逐年上调的蛋白质2个,2年至5年哈蟆油逐年下调的蛋白质6个,3年比2年哈蟆油上调并且5年比3年哈蟆油下调的蛋白质20个。生物信息学分析结果显示,不同蛙龄哈蟆油的差异蛋白比较多的集中在细胞过程、代谢过程、单一生物过程、生物过程调控和生物调节这几个生物学途径,连接功能和催化活性这两类分子功能以及细胞、细胞部分、大分子复合物、细胞器和细胞器部分这几个细胞组分。这些差异蛋白主要参与NOD样受体信号通路、氨基糖和核苷酸糖代谢、RNA降解代谢、淀粉和蔗糖代谢等代谢过程。通过对不同蛙龄哈蟆油的差异蛋白的筛选,从蛋白质的角度对不同蛙龄的哈蟆油进行分析,为哈蟆油的质量评价提供了新思路。
文章目录
1 材料与仪器
1.1 哈蟆油药材
1.2 试剂
1.3 主要仪器
2 试验方法
2.1 哈蟆油总蛋白的提取及质量检测
2.1.1 哈蟆油总蛋白的提取
2.1.2 SDS-PAGE电泳检测
2.2 iTRAQ定量分析
2.3 差异蛋白的筛选
2.4 生物信息学分析
3 结果与分析
3.1 不同蛙龄哈蟆油总蛋白质量检测结果
3.2 iTRAQ结合2D LC-MS/MS质谱鉴定结果
3.3 鉴定蛋白的理化性质分析
3.4 不同蛙龄哈蟆油差异蛋白筛选结果
3.5 GO功能注释结果
3.6 KEGG代谢通路分析
4 讨论与结论
4.1 利用iTRAQ蛋白质组学技术研究不同蛙龄哈蟆油中蛋白质表达差异
4.2 不同蛙龄哈