摘要：该研究旨在探究不同种类预制菜的微生物菌群结构和多样性。利用Illumina高通量测序平台，对4类69个预制菜样本（猪肉类、鸡肉类、鱼肉类、虾肉类）进行了微生物多样性及菌群结构分析。结果表明，检测到的25 162个OTU中共有4类预制菜OTU仅占0.84%，说明预制菜中微生物物种多样性高但其组成具有独特性。经Alpha和Beta多样性分析，猪肉类预制菜微生物多样性高，鱼肉类微生物多样性低，鸡肉类微生物多样性最丰富且分布最均匀，虾肉类预制菜微生物种类少且均匀度低，畜禽类预制菜（猪肉类、鸡肉类）与水产类预制菜（鱼肉类、虾肉类）在主成分分析图中分离度明显。在优势菌群方面，变形菌门（Proteobacteria）是4类预制菜中丰度最高的优势菌，鸡肉类预制菜中不动杆菌属（Acinetobacter）丰度最高，虾肉类预制菜含有较高丰度的明串珠菌属（Leuconostoc），鱼肉类预制菜含有较高丰度的嗜冷杆菌属（Psychrobacter）和金黄杆菌属（Chryseobacterium），猪肉类预制菜含有较高丰度的芽孢杆菌（Bacillus）。从聚类结果来看，猪肉类和鸡肉类预制菜在微生物群落结构上具有一定的相似性。这为预制菜微生物安全控制及品质保障提供了重要的理论依据和数据支持。
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.2 仪器与设备
1.3 实验方法
1.3.1 样品处理
1.3.2 DNA提取
1.3.3 PCR扩增及高通量测序
1.3.4 数据预处理
1.3.5 数据分析
2 结果与分析
2.1 预制菜中微生物多样性分析
2.1.1 OTU统计和特征分析
2.1.2 Alpha多样性分析
2.1.2.1 ACE和Chao1指数分析
2.1.2.2 Shannon和Simpson指数分析
2.1.3 Beta多样性分析
2.2 微生物菌群结构分析
2.2.1 门水平群落组成
2.2.2 属水平比较分析
3 结论与讨论
3.1 不同种类预制菜微生物多
