摘要：为了阐明海带降解微泡菌ALW1代谢海带多糖的分子机理，本研究进行ALW1菌株代谢海带多糖的蛋白质组研究，利用二维凝胶电泳（2-DE）和质谱（MS）技术鉴定菌株ALW1代谢三种多糖（昆布多糖、岩藻多糖和果胶）的差异蛋白质。二维凝胶电泳显示了202个差异表达的蛋白质斑点，利用质谱最终鉴定了161个蛋白质。聚类分析结果表明，以昆布多糖为碳源培养的细胞内蛋白，与岩藻多糖和果胶培养的细胞内蛋白相比，共鉴定出35种上调蛋白；以岩藻多糖为碳源培养的细胞内蛋白与其他两种蛋白样品相比，共鉴定出88种上调蛋白；以果胶为碳源培养的细胞内蛋白与其他两种蛋白样品相比，共鉴定出68种上调蛋白。GO分析表明，差异表达蛋白质在细胞成分上主要集中在细胞和细胞组成部分，在分子功能上主要集中在催化活性和结合功能上，并且主要参与细胞过程和生物体中的代谢过程。微泡菌ALW1代谢不同海带多糖的蛋白质组研究为该菌株代谢多糖的分子机理，以及利用该菌株生产海带低聚糖和寡糖奠定理论基础。
