摘要:本研究通过网络药理学方法及分子对接技术探究了蒲公英缓解奶牛热应激的作用机制。结合本草组鉴数据库(Herb)、已报道文献检测结果与中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选获得蒲公英的有效活性成分;利用Swiss Target Prediction、Gene Cards数据库获得有效活性成分抗热应激靶点。通过STRING数据库、Cytoscape 3.9.1软件获得蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络及核心靶点;通过David数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析;通过分子对接技术对活性成分与核心靶点进行对接验证。结果表明:蒲公英5种有效活性成分作用于185个抗热应激靶点;细胞凋亡蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、B细胞淋巴瘤/白血病2(BCL2)、缺氧诱导因子1α(HIF1A)、白细胞介素1β(ILIB)、表皮生长因子受体(EGFR)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)等预测为核心靶点;GO功能富集分析获得201个生物过程、33个细胞组成及70个分子功能(P<0.01);KEGG通路富集分析得到158条相关信号通路(P<0.01);蒲公英5种有效成分可与核心靶点稳定结合。研究表明蒲公英可能通过PI3K-Akt、MAPK、HIF-1及NF-κB等信号通路发挥抗热应激作用,为蒲公英在奶牛养殖中的进一步应用提供了理论依据。
文章目录
1 材料与方法
1.1 蒲公英有效活性成分及作用靶点筛选
1.2 热应激相关靶点收集
1.3 蒲公英-热应激交集靶点整理
1.4 PPI网络构建及核心靶点筛选
1.5 GO功能和KEGG通路富集分析
1.6 蒲公英缓解热应激的成分-靶点-通路网络
1.7 分子对接
2 结 果
2.1 蒲公英有效成分和作用靶点
2.2 蒲公英缓解热应激靶点网络构建及核心靶点筛选
2.3 GO功能和KEGG通路富集分析
2.4 交集靶点筛选及核心靶点图构建
2.5 分子对接结果
3 讨 论
3.1 蒲公英活性成分作用
3.2 蒲公英缓解热应激的可能靶点
3.3 蒲公英缓解热应激的功能通路
4 结 论