摘要：【背景】我国养猪业正面临猪流感病毒(Swine influenza virus， SIV)的严峻挑战，流行毒株主要包括H1N1、H3N2和H1N2等，持续威胁养猪业的健康发展。【目的】本研究旨在深入剖析广东地区猪流感病毒的流行毒株遗传进化特征，并对其致病性进行系统评估。【方法】2021-2023年间，从广东省佛山、肇庆、清远、韶关等地级市的21个猪场采集疑似感染SIV的鼻拭子和肺脏病料样品共536份，其中45份样品经荧光定量RT-PCR测定为SIV阳性，采用犬肾上皮(Madin-Darby Canine Kidney， MDCK)细胞分离培养病毒，并进行全基因组测序分析。将所得序列与GenBank和GISAID收录的参考毒株序列进行比对，并构建进化树，揭示病毒的遗传进化特征。【结果】本研究成功分离到4株SIV，其中2株EA H1N1亚型SIV(SWSG1/21、SWHRZ3/22)，其HA和NA基因源自EA分支，其他基因片段(PB2、PA、PB1、NP和M)源自Pdm/09分支，NS基因则源于TR H1N2分支。另分离到2株H1N2亚型重配毒株(SWLFT4/22和SWHH5/23)，其中SWLFT4/22由NA H1N2分支与Pdm/09 H1N1分支毒株重配而成，而SWHH5/23则涉及三个不同分支毒株的复杂重配。致病性试验结果表明，所有4株SIV均能导致小鼠死亡，尤其是SWSG1/21和SWLFT4/22表现出较强的致病性，死亡率高达100%。【结论】本研究通过对广东地区猪群分离的4株SIV进行遗传进化和致病性分析，揭示了当地SIV复杂的基因重组背景及较强的致病性，为猪流感的防控策略制定提供了关键科学依据。
文章目录
1 材料与方法
1.1 样品
1.2 培养基、主要试剂和仪器
1.3 病毒分离鉴定
1.4 病毒RNA宏基因组测序与分析
1.5 分离株遗传进化分析
1.6 小鼠致病性试验
2 结果与分析
2.1 SIV的分离与鉴定结果
2.2 病毒分离株全基因组序列测定与核苷酸遗传进化分析
2.3 关键氨基酸位点的分析
2.4 SIV对小鼠致病性试验
2.4.1 小鼠体质量与存活率
2.4.2 小鼠病理组织学观察
3 讨论
4 结论
