基于转录组学和生物信息学探究P65/MMRN2信号通路驱动黑色素瘤脑转移的实验研究

2025-06-18 40 1.66M 0

  摘要:目的:探究敲低MMRN2对黑色素瘤B16F10-BM生长和脑转移能力的影响。方法:在超声引导下通过左心室内注射法在C57BL6/J黑鼠中建立B16F10-luc黑色素瘤脑转移动物模型,通过组织块贴壁法将黑色素瘤组织原代培养获得B16F10-F1细胞(F1代细胞)。经过3个“心内注射-分离脑转移瘤-原代培养获取脑转移黑色素瘤细胞”循环后,获得了高脑转移黑色素瘤细胞系B16F10-BM。通过转录组学测序、生物信息学分析结合了临床数据库,筛选出脑转移的关键分子MMRN2;通过使用多个在线数据预测关键分子MMRN2的转录因子,Western blot检测P65、p-p65相关蛋白的表达;采用shRNA感染的细胞实验研究MMRN2对B16F10-BM细胞表型的影响;将对照组B16F10、B16F10-BM和MMRN2shRNA感染的B16F10-BM注射到C57BL6/J黑鼠左心室内,每组6只。建立黑色瘤脑转移模型,10 d后通过小动物活体成像监测小鼠脑部荧光信号强度并处死黑鼠,取脑组织进行H&E染色形态学观察,通过IHC检测黑色素瘤脑组织中CD31、CD34、VEGFA的表达。结果:在黑色素转移瘤中,MMRN2表达显著上调(P<0.001);P65是MMRN2的上游转录因子(P<0.05);敲低MMRN2后抑制B16F10-BM细胞的脑转移(P<0.05)并阻碍肿瘤血管的生成(P<0.05)。结论:抑制MMRN2的表达能够减缓C57BL6/J小鼠黑色素瘤的生长并降低其脑转移能力。

  文章目录

  1. 材料与方法

  1.1主要材料与试剂

  1.2 动物

  1.3方法

  1.3.1心内注射法建立MBM瘤模型

  1.3.2转录组学分析

  1.3.3黑色素瘤预后分子的筛选

  1.3.4 GO和KEGG富集分析

  1.3.5基因相关性分析和构建蛋白交互网络

  1.3.6 Cox-Lasso分析

  1.3.7转录调控预测

  1.3.8细胞实验

  1.3.9蛋白印迹分析

  1.3.10动物实验

  1.3.11 H&E染色

  1.3.12免疫组化

  1.4统计学处理

  2.结果

  2.1心内注射法建立脑转移模型获得高脑转移性黑色素瘤细胞

  2.2转录组学结果和风险分子筛选

  2.3 MMRN2是脑转移和不良预



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