基于失巢凋亡相关lncRNAs的头颈鳞癌新型预后模型构建与验证

2025-05-30 80 1.97M 0

  摘要:为探讨失巢凋亡相关lncRNAs(Anoikis-related lncRNAs,ARLs)在头颈鳞癌(Head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)中的预后价值并构建预后和免疫活性模型,从癌症基因组图谱(The cancer genome atlas,TCGA)数据库下载 HNSCC患者的转录组数据(RNA-sequencing,RNA-seq)和临床资料;利用生物信息学方法筛选预后相关ARLs,构建预后模型并验证准确性,随后检测其相关免疫浸润情况;最后通过一系列体外实验验证数据库分析结果的准确性。预后模型包括6个ARLs,具有较高的预测HNSCC患者预后效能,可作为HNSCC患者独立预后因素,且该模型可以用来预测患者免疫活性。此外,实时荧光PCR(real-time PCR,RT-PCR)结果与数据集分析结果一致。流式分析结果显示,ARLs显著影响HNSCC细胞失巢凋亡(P < 0.01)。研究表明构建的ARLs是一个新且高效的预后和免疫活性预测模型,为失巢凋亡在HNSCC临床预后中的研究奠定基础。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 数据采集

  1.2 ARLs预后模型的构建及验证

  1.3 免疫细胞浸润评估

  1.4 细胞培养

  1.5 Real-time PCR

  1.6 小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)转染

  1.7 流式细胞术

  1.8 统计分析

  2 结果

  2.1 数据处理及预后ARLs鉴定

  2.2 预后模型的构建与验证

  2.3 风险评分是HNSCC的独立预后因素

  2.4 高低风险组免疫状态差异

  2.5 细胞中ARLs的表达水平

  2.6 ARLs在体外促进HNSCC细胞失巢凋亡

  3讨论



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