随着基因组学和生物技术的快速发展,萝卜品种改良工作由传统育种向分子设计育种与智慧育种阶段转型。本文中系统综述了萝卜核基因组、泛基因组与细胞质基因组研究的最新进展;围绕主要育种目标重点探讨了萝卜肉质根形成膨大、主要病害与非生物胁迫抗性、品质、抽薹性与雄性不育等重要性状相关的分子基础以及在分子育种领域的应用。基于基因组信息与性状分子基础初步提出萝卜“精准智慧育种”策略的理论框架;通过整合多组学数据进行综合分析揭示复杂性状的调控机制;强化快速育种研究,建立从基因型—表型—环境互作到设计育种的精准智慧育种技术体系,为实现萝卜等十字花科蔬菜作物“产量—抗性—品质”协同遗传改良提供理论和技术支撑。