TXN在泛癌中的表达特征及其对肿瘤免疫及预后的影响

2025-04-09 110 2.02M 0

  摘要:目的 TXN是一种硫氧还蛋白(TXN),参与许多氧化还原反应,在多种信号通路中起着关键作用。然而,TXN在泛癌中的作用仍然不清楚。本研究旨在探讨及可视化 TXN 表达在泛癌中的诊断、预后和免疫学分析。方法 从癌症基因组图谱计划(TCGA)数据库下载临床数据,分析TXN在泛癌中的表达水平,并通过人类蛋白质图谱(HPA)(https://www.proteinatlas.org/)数据库初步验证。采用ESTIMATE和CIBERSORT算法评估TXN表达与免疫细胞浸润的相关性。同时,利用Spearman方法分析TXN与微卫星不稳定性(MSI)及肿瘤突变负荷(TMB)在肿瘤中的相关性。此外,通过基因集富集分析(GSEA)探讨TXN的生物学功能,并运用CellMiner数据库评估其与癌症治疗药物的敏感性关系。结果 TXN在大多数恶性肿瘤中表现出高水平表达。其高表达与多种癌症的生存存在显著相关性。此外,TXN表达水平也与 TMB、MSI、肿瘤微环境和化疗敏感性等密切相关。结论 TXN有望作为泛癌中的潜在预后生物标志物。同时,黄酸(维甲酸)诱导基因蛋白I(RIG-I)样受体信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路以及核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体信号通路可能在TXN对肿瘤免疫的调节中发挥关键作用。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 材料

  1.2 方法

  1.2.1 TXN基因表达分析

  1.2.2 TXN的免疫组化染色

  1.2.3 生存分析

  1.2.4 TXN表达与肿瘤免疫微环境的相关性

  1.2.5 微卫星不稳定性(microsatellite instability ,MSI)和肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)与TXN在泛癌中的相关性

  1.2.6 TXN在泛癌中的基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)分析

  1.2.7 TXN表达与药物敏感性的相关性

  1.2.8 统计学分析

  2 结果

  2.1 TXN基因在泛癌中的表达特征

  2.2 生存分析

  2.3 TXN与肿瘤分期的相关性

  2.4 TXN与肿瘤微环境相关性

  2.5 TXN与MSI和TMB在泛癌中的相关性

  2.6 TXN在泛癌中的GSEA分析

  2.7 TXN表达与药物敏感性的相关性

  3 讨论



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