摘要:【目的】通过鉴定5-氨基乙酰丙酸(ALA)缓解酸枣NaCl胁迫相关miRNAs,为阐明miRNA及核心靶基因参与ALA缓解NaCl胁迫的分子机制提供理论依据。【方法】以酸枣水培幼苗为试验材料,设置叶面喷施蒸馏水为对照(CK)、叶面喷施ALA处理(ALA)、营养液中添加NaCl溶液和叶面喷施蒸馏水(NaCl)及营养液中添加NaCl溶液和叶面喷施ALA(ALA+NaCl)4个处理,进行高通量测序,鉴定了响应ALA缓解酸枣NaCl胁迫过程的miRNAs及靶基因。【结果】从4个处理共12个文库中分析鉴定到149个已知的miRNA属于31个miRNA家族和11个novel miRNA。许多响应盐胁迫的miRNAs,如zju-miR172d、zju-miR395i和zju-miR172a均显著下调,表明这些miRNAs可能受单一盐胁迫抑制,进一步分析发现,ALA显著抑制了zju-miR408a的表达,对zju-miR408a的靶基因进行注释,结果包括过氧化物酶、原卟啉原氧化酶,线粒体、木质素形成阴离子过氧化物酶、钙依赖性蛋白激酶1、漆酶等。qRT-PCR 分析结果与测序结果基本一致。【结论】本研究ALA通过抑制zju-miR408a的表达上调靶基因POD的表达量达到清除活性氧的目的,从而提高酸枣的耐盐性。该结果为更全面的解析ALA缓解酸枣盐胁迫的miRNA提供了新的信息。
文章目录
1材料与方法
1.1 试验材料与处理
1.2 形态指标和生理生化指标测定
1.3 small RNA文库的构建及测序分析
1.4 sRNA注释和miRNA鉴定
1.5 miRNA差异基因筛选
1.6 靶基因功能富集分析
1.7差异表达的miRNA及其靶基因的RT-qPCR验证
1.8 统计分析
2结果与分析
2.1试验处理后酸枣幼苗表型
2.2酸枣sRNA文库测序与分析
2.3 酸枣叶片miRNAs的鉴定
2.4 酸枣叶片中miRNAs表达定量分析
2.5差异miRNA分析
2.6 差异基因功能富集分析及响应盐胁迫的miRNA408a靶基因预测
2.7 酸枣叶片POD酶活性及zju-miRNA408a和靶基因qRT-PCR验证
3讨论
4 结论