根肿病(Clubroot)是由专性活体营养型原生生物芸薹根肿菌(Plasmodiophorabrassicae Woronin)引起的土传病害,现已成为全球十字花科作物生产中最具破坏性的病害之一。值得注意的是,该病害的疫区分布近年来呈显著扩张趋势。因此,系统阐明根肿菌致病分子机理与芸薹属寄主免疫应答网络调控机制对于抗病品种的培育以及综合防控体系构建至关重要。当前,基于高通量测序技术的突破性进展及多组学数据的增长,研究者已从多维视角揭示了根肿菌—芸薹属寄主植物互作界面的分子图谱。本文系统综述了该领域的重要研究进展,重点探讨多组学技术集成在根肿菌病原生物学特性解析、抗性基因定位及根肿菌—芸薹属寄主互作机理解码中的关键作用,旨在为构建靶向抗根肿病分子育种策略和创新病害防控方案提供理论依据与技术路径参考。