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R-loop是一种由DNA:RNA杂合链与互补单链DNA共同形成的三链核酸结构.作为基因组中普遍存在的调控元件, R-loop在原核和真核生物中参与调控DNA损伤修复及转录调控等关键生物学过程,同时对组蛋白修饰及染色质高级结构等表观遗传景观具有调控作用.然而,当R-loop动态平衡被打破导致其异常积累时,将造成DNA损伤、基因组不稳定及染色质结构异常,进而与多种肿瘤性疾病和遗传性疾病的发病机制密切相关.目前,研究人员已开发出多种R-loop检测技术,主要包括基于S9.6抗体或RNaseH1杂合链结合结构域的亲和富集技术,以及基于单分子标记的spKAS-seq或核酸酶切割的RIAN-seq等非亲和富集方法.本文系统介绍了R-loop的形成分子机制、生理病理功能及其检测技术的研究进展,旨在为深入理解R-loop的生物学意义及其在疾病中的作用提供理论参考.