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摘要：分析了辣椒自交系1189不同发育时期果实转录组和类胡萝卜素靶向代谢组，基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）鉴定了可能参与调控辣椒类胡萝卜素生物合成相关基因的转录因子。靶向代谢组共鉴定出60种类胡萝卜素代谢物，分析发现，幼果期和绿熟期果实类胡萝卜素主要组分均为叶黄素（73.4%和64.5%），转色期叶黄素含量急剧下降，红熟期则主要为辣椒红素（32.5%），无法检测到叶黄素。转录组分析共鉴定出14 148个差异表达基因和15个类胡萝卜素代谢相关差异表达基因。通过WGCNA将筛选所得12 286个差异表达基因划分至16个模块，发现MEdarkseagreen4、MElightcyan1和MEbrown2模块与11种主要类胡萝卜素组分显著相关。基于3个模块中类胡萝卜素相关差异表达基因构建代谢调控网络，并通过分析启动子结合基序，筛选出bHLH48、SEP3、CMB1、AGL27、YABBY2、GT-3B、NF-YA3、NAC2、HOX5和GATA26等10个转录因子可能在类胡萝卜素积累中发挥重要调控作用。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 靶向代谢组测定与分析
1.3 RNA-Seq测序与分析
1.4 WGCNA分析及基因网络可视化
1.5 类胡萝卜素代谢共表达网路构建及分析
1.6 实时荧光定量PCR（RT-qPCR）分析
2 结果与分析
2.1 类胡萝卜素组分及含量的变化分析
2.2 差异表达基因筛选
2.3 差异表达基因功能富集分析
2.4 加权基因共表达网络分析（WGCNA）
2.5 类胡萝卜素代谢途径差异表达基因分析
2.6 类胡萝卜素生物合成关键基因调控网络构建与分析
2.7 RT-qPCR验证基因表达谱
3 讨论
3.1 辣椒类胡萝卜素含量变化
3.2 促进类胡萝卜素积累的重要途径基因
3.3 辣椒类胡萝卜素生物合成的调控网络
4 结论
