摘要:北部湾涠洲岛地区生态环境条件复杂且富营养化趋势逐渐显现,有孔虫是海洋环境变化的重要指标,而有孔虫相关调查研究未曾开展。为探究底栖有孔虫的群落结构、多样性及其与环境因子之间的关联,在涠洲岛周边设置9个采样站位,采集表层沉积物并提取eDNA,利用有孔虫特异性引物s14F1和s17扩增得到目的片段并进行测序。分析结果表明:共获得932 462条有效测序数据,经处理后最终有3 594条OTUs成功注释到有孔虫,Rotaliida目、Monothalamida目和Textulariida目展现出较高丰度;α多样性指数和主坐标分析(PCoA)显示,有孔虫的多样性分布与珊瑚礁和人类活动相关;基于距离的冗余分析(db-RDA)结果显示,溶解氧和营养盐是显著影响有孔虫eDNA多样性的关键因素;此外,曼特尔检验(Mantel test)显示溶解氧和亚硝酸盐是影响有孔虫分子多样性的关键环境因素,暗示低氧与高营养盐环境共同塑造了底栖有孔虫的群落格局。该研究为理解北部湾近岸生态系统的健康状况提供了科学参考,也为全球有孔虫数据库的完善与潜在新种的研究提供了线索。
文章目录
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 环境因子获取
1.3 DNA提取
1.4 PCR扩增
1.5 文库构建和测序
1.6 生物信息学分析
1.6.1 数据质控
1.6.2 统计分析
2 结果
2.1 数据概述
2.2 分类组成和相对丰度
2.3 群落组成及各站位间差异
2.4 底栖有孔虫物种多样性与环境因子相关性分析
3 讨论
3.1 北部湾涠洲岛地区底栖有孔虫群落
3.2 有孔虫丰度与溶解氧浓度显著相关
3.3 营养盐对有孔虫的分布具有显著影响作用
4 结论