摘要：背景：罗伊氏粘液乳杆菌（Limosilactobacillus reuteri）原名罗伊氏乳杆菌，是一种兼性发酵乳酸菌，常见于脊椎动物和哺乳动物的胃肠道中，具有降胆固醇、抑制病原菌和提高机体免疫等功能特性，被广泛应用于食品发酵行业。方法：本研究以L. reuteri AR673为对象，通过全基因组测序和比较基因组分析，解析了L. reuteri AR673潜在益生功能的分子基础和相关基因。结果：测序结果表明L. reuteri AR673基因组无质粒，染色体长2.04 Mbp，GC含量38.88%，包含2016个蛋白质编码基因。功能分析发现L. reuteri AR673包含抗菌活性物质合成基因、与环境压力耐受性相关基因以及可移动元件。比较基因组分析发现37株罗伊氏粘液乳杆菌泛基因组呈开放型，大小为5066，核心基因组大小为1190，另外还包含1167个菌株特异性基因。系统发育分析显示L. reuteri AR673和L. reuteri TK-F8A同源性最高，可能具备抑制病原微生物生长、增强宿主免疫系统等益生特性。结论：本研究为丰富罗伊氏乳杆菌的物种进化库，挖掘罗伊氏乳杆菌潜在的益生功能奠定了基础。
文章目录
1 材料与方法
1.1 实验菌株
1.2 菌株培养方法
1.3 全基因组测序与分析
1.4 比较基因组分析
2 结果与分析
2.1 罗伊氏乳杆菌AR673的基因组特征
2.2 COG功能分类以及KEGG功能注释
2.3 抗应力分析
2.4 比较基因组
2.4.1 比较基因组基本特征
2.4.2 泛基因组分析
2.4.3 碳水化合物活性酶（CAZymes）
2.4.4 次级代谢产物合成基因簇比较
3 讨论
4 结论
