摘要：以人参（Panax ginseng C. A. Meyer）为试材，采用基因组学和比较基因组学分析方法，鉴定和分析了人参GRAS基因家族成员，并对其蛋白理化性质、系统进化关系、基因结构、细胞亚定位和染色体分布情况以及启动子顺式作用元件等进行预测，同时，对该基因家族在人参不同器官和不同生长年限的表达模式进行初步解析，以期为改善人工栽培人参的品质、破解连作障碍、推动人参栽培产业的可持续发展提供参考依据。结果表明：人参基因组中共鉴定到GRAS转录因子基因家族成员119个，不均匀地分布在20条染色体上，分别重命名为Pgras 01～Pgras 119，蛋白序列大小349～799 aa，分子量38.94～87.12 kD。亚细胞定位结果显示，所有成员均位于细胞核。系统发育分析将其划分为13个亚家族，且同一亚家族成员具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现，家族成员间存在11个串联重复事件，片段重复区域内存在113个GRAS同源基因对，推测片段重复可能是人参GRAS基因变异的主要途径。启动子顺式作用元件分析结果显示，人参GRAS家族成员中光响应元件最多，共有1 409个，其次为植物激素茉莉酸甲酯响应元件，共有248个。此外，人参GRAS基因的表达模式具有器官特异性和生长年限累积效应。
文章目录
1 材料与方法
1.1 家族成员鉴定与理化性质分析
1.2 进化树分析
1.3基因结构分析
1.4 染色体定位与共线性分析
1.5 启动子区域顺式作用元件分析
1.6 基于RNA-Seq数据的基因表达分析
2 结果与分析
2.1 GRAS基因家族成员鉴定与理化性质分析
2.2 系统进化分析
2.3 基因结构与保守基序分析
2.4 染色体定位与共线性分析
2.5 启动子区域顺式作用元件分析
2.6 表达模式分析
3 讨论
4 结论
