摘要：以葡萄为试材，基于已公布的葡萄基因组序列和注释信息，采用生物信息学方法对葡萄VvWAK/WAKL基因家族进行鉴定，研究了其染色体定位、理化性质、亚细胞定位、二级结构、系统进化、共线性、保守基序、基因结构、启动子顺式作用元件以及在白腐病病原菌侵染下的表达模式，以期为葡萄的遗传改良和抗逆育种奠定理论基础。结果表明：葡萄VvWAK基因21个，VvWAKL基因26个，47个VvWAK/WAKL基因分布在10条染色体上，且10、17、18号染色体上数量最多。葡萄VvWAK/WAKL家族蛋白的氨基酸数量在353～1 048 aa，分子量和等电点分别在40.57～116.76 kD和8.07～8.87。葡萄VvWAK/WAKL基因家族亚细胞定位主要在质膜和液泡膜，主要的二级结构是α-螺旋和无规则卷曲。系统发育分析将VvWAK/WAKL基因家族划分为5组，各组间成员保守基序及基因结构相似。进化分析表明VvWAK/WAKL基因家族在葡萄内有22个串联重复基因，与拟南芥存在7对同源基因。在VvWAK/WAKL基因家族的启动子区域检测到大量与光响应有关的元件以及与脱落酸、水杨酸、赤霉素、茉莉酸甲酯、生长素等激素有关的响应元件。在白腐菌株侵染葡萄的转录组数据分析中发现，有18个家族成员在侵染6 h后被高度诱导表达。
文章目录
1 材料与方法
1.1 葡萄WAK/WAKL基因家族的鉴定
1.2 葡萄WAK/WAKL基因家族的染色体定位、命名及理化性质分析
1.3 系统发育分析
1.4 葡萄WAK/WAKL进化分析
1.5 保守结构域及基因结构分析
1.6 顺式作用元件鉴定与分析
1.7 表达模式分析
2 结果与分析
2.1 葡萄WAK/WAKL基因家族鉴定
2.2 葡萄VvWAK/WAKL基因家族染色体定位及命名
2.3 VvWAK/WAKL基因家族的理化性质、亚细胞定位及二级结构分析
2.4 葡萄VvWAK/WAKL基因家族系统发育分析
2.5 葡萄VvWAK/WAKL基因家族进化分析
2.6 葡萄VvWAK/WAKL基因家族保守基序及基因结构分析
2.7 葡萄VvWAK/WAKL基因家族启动子区域顺式作用元件分析
2.8 白腐病病原菌侵染下葡萄VvWAK/WAKL基因家族表达模式分析
3 讨论与结论
