目的 建立氨基戊二烯环脂肽类化合物(APD-CLDs)基因簇携带菌株的筛选策略,从实验室建立的放线菌菌种库中筛选并分析APD-CLDs基因簇携带菌株。方法 采用PCR技术结合基因组扫描,成功筛选出7株携带APD-CLDs基因簇的放线菌,并对这些菌株进行了基因组测序和分析。结果 基因组分析结果表明,Micromonospora sp. FIM99-461、Micromonospora sp. FIM030746、Micromonospora sp. FIM060002、Micromonospora sp. FIM090374和Streptomyces sp. FIM18-1089菌株中存在与rakicidins生物合成基因簇,而Streptomyces sp. FIM15-0361和Streptomyces sp. FIM16-0599菌株的APD-CLDs基因簇则表现出一定的差异。模式菌株基因组服务器(TYGS)分析揭示,FIM16-0599、FIM18-1089和FIM99-461等3株为放线菌潜在新种。此外,在菌株FIM99-461、FIM03-0746、FIM06-0002和FIM09-0374菌株的发酵液中检测到了rakicidin A。结论 建立了高效的APD-CLDs基因筛选策略,获得了多株APD-CLDs基因簇携带菌株。研究为APD-CLDs的生物合成研究和新药开发提供了新的资源,也为微生物次级代谢产物的筛选提供了新的方法和思路。