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摘要：格氏乳球菌(Lactococcus garvieae)是一种广泛存在于白酒酿造生态系统的功能微生物，在发酵过程中不仅能产生的多种风味物质，还能在维持酿造体系的生态平衡中起关键作用。本研究对4株窖泥环境L. garvieae进行功能基因注释，并结合其他生态位L. garvieae进行泛基因组分析，探究其系统发育中的群体特征及白酒环境下的个体特异性。结果表明L. garvieae的泛基因组表现出开放的状态，核心基因组主要涉及菌体的基础代谢功能。核心基因组KEGG注释表明L. garvieae基因组均能够产生促进微生物生长的纤维素酶、糖化酶、酯酶，同时产生乳酸、乙酸、乙醇等前体物质，通过酯酶催化生成乳酸乙酯和乙酸乙酯。毒力因子分析评估窖泥环境的4株L. garvieae在自身基因水平上具有安全性，但也有可能会受到外界调控。L. garvieae中存在大量的水平基因转移。本研究相关结果揭示了L. garvieae遗传多样性和进化特征，为其在白酒行业中的应用提供了一定理论依据。
文章目录
1 实验材料
1.1 实验所需格式乳球菌信息收集
1.2主要软件与数据库
2 实验方法
2.1 数据采集与基因注释
2.2泛基因组分析
2.3系统发育分析
2.4基因功能注释
2.5毒力因子注释
2.6原噬菌体序列和基因组岛预测
3 结果与分析
3.1泛基因组分析结果
3.2 L. garvieae系统发育分析
3.3 L. garvieae功能注释
3.4 L. garvieae毒力因子分析
3.5基因岛和原噬菌体预测
4 结论与讨论
