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摘要：多胚或单胚是甜菜种子重要品种特征。为了分析甜菜单胚雄性不育系和多胚雄性不育系中circRNA的表达模式与种子胚数性形成的关系。使用RNA测序方法，对遗传特征相似的单胚和多胚甜菜雄性不育系进行了全转录组研究。结果表明：共鉴定出circRNA 817个，组织特异表达528个，共筛选差异表达circRNA 6个，DEGs 1 896个，差异miRNA 26个；对表达有差异的circRNA和mRNA进行了GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析，观察到差异表达基因(DEGs)主要在苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成和蛋白酶组等方面集中；差异表达的circRNA主要与辅因子生物合成和次级代谢产物生物合成有关。通过构建的circRNA-miRNA-mRNA共表达互作网络，分别筛选到以novel＿circ＿0001051、novel＿circ＿0001470和novel＿circ＿0001443等为核心的转录后调控因子，以AGO2和CHLH为核心的靶基因。5个circRNA和5个miRNA的RT-qPCR检测结果与全转录组测序结果趋势一致。综上，circRNA在甜菜单胚雄性不育系和多胚雄性不育系中的差异表达与种子胚数性形成具有相关性，本研究结果为下一步深入研究甜菜种子胚数性形成的分子机制提供参考。
文章目录
1结果与分析
1.1甜菜全转录组数据统计分析
1.2 circRNA鉴定与表达量分析
1.3差异表达基因和miRNA分析
1.4 DEGs和差异表达circRNA的GO和KEGG富集分析
1.5 circRNA和miRNA靶向关系分析
1.6circRNA-miRNA-mRNA共表达互作网络
1.7差异表达circRNA和miRNA的RT-qPCR检测
2讨论
3材料与方法
3.1试验材料
3.2总RNA的提取与质控
3.3 cDNA文库的构建和转录组测序
3.4数据的处理与分析
3.5差异表达基因的功能和通路富集分析
3.6 circRNA和miRNA靶向位点预测
3.7实时荧光定量PCR验证
3.8数据统计与分析
