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摘要:转录因子在植物生长发育过程中有重要调控功能。基于罗汉果基因组和转录组信息,筛选得到罗汉果TCP转录因子家族SgTCP6基因,并进行生物信息学分析,结合酵母单杂交实验验证其是否参与罗汉果甜苷合成关键酶基因SgUGT94的调控。结果显示:SgTCP6基因开放阅读框(CDS)序列全长为618 bp,编码205个氨基酸残基,相对分子质量为21.94 kDa,定位于细胞核中,是一种不稳定的亲水蛋白,且不含信号肽和跨膜区,为非分泌蛋白。多序列比对结果显示该基因与葫芦科苦瓜TCP基因的亲缘关系较近。罗汉果不同时期果实基因共表达关联分析结果显示,SgTCP6与SgUGT94表达存在极显著相关性。SgUGT94上游2 000 bp启动子区域含有4个TCP顺式作用元件。酵母单杂交结果表明,SgTCP6可能参与罗汉果甜苷V合成关键酶基因SgUGT94的调控。
文章目录
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 SgTCP6基因与SgUGT94启动子序列的克隆
1.2.2 生物信息学分析
1.2.3 亚细胞定位
1.2.4 酵母表达载体构建
1.2.5 诱饵载体自激活检测与SgTCP6蛋白与SgUGT94启动子互作验证
2 结果与分析
2.1 SgTCP6基因克隆及测序结果
2.2 SgTCP6的生物信息学分析结果
2.3 SgTCP6与SgUGT94基因关联分析结果
2.4 亚细胞定位结果
2.5 酵母单杂交实验结果
3 结论与讨论