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摘要：本文旨在深入探究不同品种绵羊卵巢发育过程中lncRNA(长链非编码RNA)的分子调控机制，挖掘绵羊繁殖相关基因，为提高绵羊生产效率提供参考。本研究构建多胎型（乌珠穆沁羊）和单胎型（小尾寒羊）绵羊卵巢组织非编码RNA表达谱，通过高通量测序分析，筛选差异表达DE lncRNAs、DE miRNAs及DE mRNAs，并对其进行靶基因预测以及功能和信号通路富集分析，进一步构建ceRNA（lncRNA-miRNA-mRNA）调控网络。结果显示，乌珠穆沁羊和小尾寒羊卵巢组织共筛选出差异表达lncRNAs共1 579个、miRNAs共175个及mRNAs共3 095个。差异表达lncRNAs靶基因的富集分析注释到类固醇生物合成、酮体的合成分解、组氨酸代谢等繁殖相关信号通路，结合ceRNA网络筛选出2个调控绵羊卵巢发育的关键lncRNAs。lncRNA MSTRG.26091可能通过结合bta-miR-331-3p，进而调控靶基因SDR42E2的表达；lncRNA MSTRG.18078可能通过结合bta-miR-197，进而调控靶基因BCAS1的表达，二者均通过参与到类固醇生物合成信号通路影响绵羊的卵巢发育。采用qRT-PCR方法对随机选取的9个差异表达基因进行了验证，结果证实了RNA-seq测序的准确性。
文章目录
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 试验方法
1.2.1 总RNA抽提及文库构建
1.2.2 测序数据质控与分析
1.2.3 差异表达分析及靶基因预测
1.2.4 ceRNA网络构建
1.2.5 qRT-PCR验证
2 结果与分析
2.1 测序序列质控与参考基因组比对分析
2.2 lncRNA与miRNA的筛选与鉴定分析
2.3 差异表达分析
2.4 lncRNA靶基因的富集分析
2.5 ceRNA网络分析
2.6 测序数据的qRT-PCR验证
3 讨论
4 结论
