摘要:通过EMS诱变获得一个矮杆多分蘖新种质htd1 (high-tillering and dwarf 1)。遗传分析表明其受单隐性基因调控。为初步探析其分子调控机制,构建了其近等基因系NIL-HTD1和NIL-htd1,以其产生株高差异期的叶为试验材料进行了RNA-seq分析,共鉴定到6513个差异表达基因(DEGs),其中3425个上调,3088个下调。GO富集分析发现DEGs主要富集在细胞、代谢、信号转导等生物学过程,涉及催化、结合等分子功能。KEGG富集分析表明DEGs在植物激素信号转导、MAPK植物信号、碳代谢等通路中富集。推测HTD1基因通过植物激素信号转导来调控细胞周期、细胞伸长途径相关基因影响小麦株高和腋芽分生组织发育,导致矮化多分蘖。研究结果为HTD1基因的图位克隆与分子调控机解析制奠定了基础。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 方法
1.2.1 JM22的EMS诱变与表型鉴定
1.2.2 群体构建与遗传分析
1.2.3 转录组测序文库制备及测序
1.2.4 数据分析
1.2.5 实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证
2 结果与分析
2.1 表型鉴定及遗传分析
2.2 测序数据的质控及参考基因组比对
2.3 样品相关性分析及差异表达基因鉴定
2.4 差异表达基因的GO和KEGG富集分析
2.4.1 GO功能富集分析
2.4.2 KEGG分析
2.4.3 关键差异表达基因分析
2.4.4 qRT-PCR验证
3 讨 论