科技创新是推动产业进步的核心动力。农业技术创新的有效性及其优化路径是建设农业强国的重要议题。本文以2017—2022年长江流域涉农上市公司为研究对象，运用DEA模型对各公司创新效率进行评价，并使用Malmquist模型对六年间上市公司科技创新效率在时间和空间维度上的变化趋势。此外，进一步使用Tobit模型分析影响科技创新效率的因素。研究发现，长江流域涉农上市公司存在进步率较低、硕士及以上学历人数的增加和政府补助对科技创新效率的正向促进作用不明显等问题，因此建议在加大研发投入、合理优化规模结构、加大人才引进及培养、优化政府补助结构等方面优化政策举措。
