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代谢组与转录组联合分析毕节市高海拔烟区烟叶类黄酮代谢差异

2024-05-24 19:38560下载
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  摘要:为明确毕节市高海拔地区烟叶的代谢特征,分别以该地3个烟叶产区(海拔>1 800 m)的韭菜坪2号和云烟87烟叶为材料进行代谢组与转录组联合分析,初步鉴定了韭菜坪2号与云烟87烟叶中的差异代谢物和差异基因,并通过加权基因共表达网络分析筛选了关键差异基因的模块。结果表明:3个产区的韭菜坪2号与云烟87烟叶代谢差异明显,其中类黄酮代谢物异鼠李素在韭菜坪2号中高积累;同时共鉴定出265个共有的差异表达基因,主要在类黄酮生物合成、黄酮与黄酮醇生物合成途径显著富集;加权基因共表达网络分析共鉴定出9个与异鼠李素相关的基因模块,其中2个模块显著富集到类黄酮生物合成、黄酮与黄酮醇生物合成途径;进一步研究分析发现,韭菜坪2号中NtPAL1、NtCHIL、NtF3H、NtTT7和NtFLS1基因下调表达可能抑制了苯丙氨酸、山奈酚及其衍生物、槲皮素及其衍生物的积累水平,而NtASMTs、NtROMTs和NtCCoAMT等甲基转移酶基因的上调表达与烟叶中异鼠李素高积累相关。本研究结果初步表明黄酮类生物合成相关途径的对韭菜坪2号在高海拔适应性方面具有一定作用,为深入解析韭菜坪2号的高海拔生长适应性机制提供理论指导。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 材料、试剂和仪器

  1.2 方法

  1.2.1 烟叶代谢物提取

  1.2.2 液相色谱质谱条件

  1.2.3 代谢组数据分析

  1.2.4 转录组测序

  1.2.5 转录组数据分析

  2 结果与分析

  2.1 代谢组分析

  2.2 转录组分析

  2.3 加权基因共表达网络分析

  2.4 烟叶类黄酮生物合成网络分析

  3 讨论

  4 结论



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