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摘要：通过生物信息学方法对西瓜ERECTA基因（基因ID为Cla97C05G096750）的理化性质、保守结构域、跨膜结构域、蛋白质二、三级结构进行了分析，并进行了系统进化树聚类分析，克隆了西瓜ERECTA基因CDS序列全长，并对该基因组织特异性表达与非生物胁迫下的表达模式进行了分析。结果表明，西瓜ERECTA基因序列全长为6 894 bp，包含27个外显子，26个内含子，位于第5号染色体的25 867 785～25 874 678 bp区域，编码991个氨基酸。系统进化树分析表明，该氨基酸序列与甜瓜、黄瓜亲缘关系较近，同水稻的亲缘关系最远；qRT-PCR结果显示，ERECTA基因在雌花和叶片中表达量较高，在茎中表达量最低，在盐胁迫下上调表达，在干旱和低温胁迫下表达呈先升后降趋势，推测其在逆境胁迫中发挥作用。本研究可为后续西瓜中该基因功能的研究及定向改良西瓜重要农艺性状提供参考。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.2.1 西瓜总RNA 提取与cDNA合成
1.2.2 西瓜ERECTA蛋白生物信息学分析
1.2.3 西瓜ERECTA基因的克隆
1.2.4 西瓜ERECTA基因的表达量分析
2 结果与分析
2.1 西瓜ERECTA基因生物信息学分析
2.1.1 西瓜ERECTA蛋白理化性质分析
2.1.2 西瓜ERECTA蛋白序列结构分析
2.1.3 西瓜ERECTA蛋白二、三级结构分析
2.1.4 西瓜ERECTA 蛋白多序列比对及系统进化分析
2.2西瓜ERECTA基因的克隆
2.3 西瓜ERECTA基因的表达量分析
3 讨论
