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为了解安徽省杂交水稻主栽品种的两系不育系之间的遗传差异，利用毛细管电泳技术，对30个两系不育系进行遗传多样性分析，并构建了其分子身份证。结果表明，48对SSR引物在30个两系不育系的扩增片段中，共检测到157个多态性片段，平均等位基因位点数为3.270 8个，平均多态性信息含量（PIC）为0.406 9，平均有效等位基因位点数为1.9019个，平均遗传相似系数为0.66。以遗传相似系数0.59为阈值，可以将30个两系不育系分为4个群，第I群包含喜08S、凤S等24个不育系；第Ⅱ群只有瑄1S；第Ⅲ群包含勇658S、新安S、广占63S、泰1S；第Ⅳ群只有皖2311S。筛选出的12个核心标记构建的分子身份证，能够有效区分30个两系不育系，将为两系不育系的精准识别和高效管理提供一条技术途径。
