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烟草NPR1基因家族鉴定及其在南方根结线虫胁迫下的表达分析

2024-05-29 15:17460下载
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  摘要:挖掘烟草抗南方根结线虫病程相关基因非表达子NPR1(non-expressor of PR genes)家族成员,并明确其功能。基于拟南芥AtNPR1家族成员蛋白序列,利用生物信息学方法鉴定分析烟草NtNPR1家族基因成员及其特征。通过qRT-PCR检测南方根结线虫侵染后抗病(NC95)、感病(长脖黄)烟草品种NtNPR1家族重要候选抗性基因的相对表达量,采用LC-MS/MS方法对2个品种烟草根系内源水杨酸含量进行检测。结果表明,从普通烟草基因组中共鉴定到12个NtNPR1基因,这些基因被分为3个亚组,同一亚组中NtNPR1家族成员蛋白结构、保守基序的长度和位置都极为相似。氨基酸长度范围为462~588 aa,均为亲水性蛋白,均位于细胞核。南方根结线虫侵染抗和、感烟草品种后,根系中水杨酸含量、NtNPR1基因家族成员表达量在抗病品种中均升高,在感病品种中则降低,其中NtNPR6的变化最为明显。综上,NPR1基因与烟草南方根结线虫抗性密切相关,NtNPR6基因可作为烟草响应南方根结线虫胁迫的重要基因。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 NtNPR1基因家族成员鉴定

  1.2 NtNPR1基因家族成员蛋白特性及亚细胞定位

  1.3 NtNPR1基因家族进化树构建和多序列比对

  1.4 NtNPR1基因家族染色体定位与蛋白结构分析

  1.5 NtNPR1基因家族顺式作用元件预测

  1.6 NtNPR1基因在南方根结线虫胁迫下表达分析和内源SA含量测定

  2 结果与分析

  2.1 NtNPR1家族成员鉴定及蛋白理化特征分析

  2.2 NtNPR1基因家族进化树构建和多序列比对

  2.3 NtNPR1基因家族染色体定位与蛋白结构分析

  2.4 NtNPR1基因家族顺式作用元件预测

  2.5 NtNPR1基因家族表达模式分析及水杨酸SA含量差异

  3 讨论与结论



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