摘要:为明确烟草TIR1/AFBs家族基因对生长素类除草剂的抗性,阐明二氯喹啉酸药害的机理,对烟草生长素受体基因家族进行鉴定,并对基因表达模式进行分析。结果表明,普通烟草存在10个NtTIR1/AFBs基因。亚细胞定位分析显示,有5个NtTIR1/AFBs定位在细胞核,3个定位在细胞质,2个定位在叶绿体。进化分析表明,NtTIR1/AFBs进化分为4类,拟南芥的AtTIR1/AFBs分为3类。蛋白结构域分析显示,NtTIR1/AFBs主要含有F-box和LRR保守结构域。在结构域的数量上,NtTIR1/AFBs和AtTIR1/AFBs存在差异。MicroRNA靶点分析发现,4个NtTIR1/AFBs含有潜在的miRNA靶点,其中20083和20090基因均含有8个miRNA靶点。组织表达分析表明,20081、20082、20088和20091 4个基因在烟草各组织中的表达量相对较高。二氯喹啉酸处理后基因表达分析显示,20085和20086基因在烟草根系中上调表达幅度较大,20082基因在烟草叶片中上调幅度最大,而20081和20090基因在烟草叶片中下调幅度较大。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验材料与仪器
1.2 试验方法
1.2.1 二氯喹啉酸处理
1.2.2基因家族鉴定和基本特征分析
1.2.3 系统进化分析
1.2.4 MicroRNA靶点分析
1.2.5 蛋白结构域分析
1.2.6基因表达分析
2 结果与分析
2.1 烟草二氯喹啉酸药害症状
2.2 NtTIR1/AFBs家族鉴定及基本特征分析
2.3系统进化分析
2.4 蛋白结构域分析
2.4 MicroRNA靶点分析
2.5 组织表达模式分析
2.6 二氯喹啉酸处理后的表达模式分析
3 讨论
4 结论