粳稻种质粒型全基因组关联分析及基因候选

　　摘要：水稻粒型与水稻产量和品质息息相关，为挖掘调控水稻粒型相关基因，以139份西北早粳稻核心种质资源为材料，结合255 501个多态性SNPs，进行全基因组关联分析。结果表明：粒长仅在水稻7号染色体关联到显著QTL；长宽比在除2、4号染色体之外的10条染色体上均关联到显著QTL。通过基因注释和单倍型分析，将LOC＿Os07g07130、LOC＿Os10g03360和LOC＿Os10g03390，3个预测基因列为影响水稻粒型的候选基因。

　　文章目录

　　1 材料与方法

　　1.1 供试材料

　　1.2 种植模式及水稻粒型鉴定

　　1.3 数据分析

　　2 结果与分析

　　2.1 水稻粒型参数统计

　　2.2 聚类分析

　　2.3 相关性分析

　　2.4 全基因组关联分析

　　2.5 基因的候选

　　2.5.1 粒长相关基因的候选

　　2.5.2 长宽比基因的候选

　　3讨论与结论