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摘要:旨在对基质金属蛋白酶组织抑制剂(TIMPs)家族成员中的TIMP1进行克隆和分析,通过过表达与敲减TIMP1,探究TIMP1对毛囊毛乳头细胞(dermal papilla cells,DPCs)毛囊生长相关基因的调控作用。本研究通过分子克隆TIMP1 编码区(coding sequence,CDS)序列,并对其进行生物信息学功能分析。之后,构建过表达载体pcDNA 3.1-TIMP1并设计合成siRNA,在DPCs中过表达和敲低TIMP1,检测毛囊生长发育相关基因的表达,并通过EdU和CCK-8检测DPCs的增殖水平。结果显示,兔TIMP1基因的CDS区全长624 bp,共编码207个氨基酸。生物信息学分析表明TIMP1蛋白存在信号肽,不包含跨膜结构域,在不同哺乳动物中存在同源性。在DPCs中过表达TIMP1能够极显著上调BMP2(bone morphogenetic protein 2)、SFRP2(secreted frizzled-related protein 2)、TGFβ1(tranforming growth factorβ1)基因的mRNA表达水平(P<0.01),极显著下调WNT2(wnt family member 2)基因的mRNA表达水平(P<0. 01),敲减TIMP1能显著下调BMP2、SFRP2基因的mRNA的表达(P<0. 05),极显著下调TGFβ1基因的mRNA表达(P<0. 01)。此外,EdU和CCK-8结果显示过表达TIMP1能够抑制DPCs的增殖,敲低TIMP1能够促进DPCs的增殖。本研究成功克隆家兔TIMP1基因CDS序列,并对其生物信息学功能进行预测,初步分析TIMP1对毛囊生长相关基因的调控作用,验证了其抑制DPCs增殖的作用,为阐明家兔毛囊生长发育的理论研究提供参考。
文章目录
1 材料与方法
1.1 试验动物
1.2主要试剂
1.3 家兔DPCs的培养与转染
1.4 RNA的提取和cDNA的合成
1.5 TIMP1过表达载体和干扰载体的构建
1.6 TIMP1的生物信息学分析
1.7 实时荧光定量PCR(RT-qPCR)
1.8 细胞增殖检测
1.9 数据统计与分析
2.结 果
2.1 TIMP1克隆与生物学信息分析
2.2 TIMP1蛋白结构预测
2.3 TIMP1基因系统进化树分析
2.4 TIMP1对毛囊发育相关基因的调控
2.5 TIMP1影响DPCs的增殖
3.讨 论
4.结 论