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粳稻种质粒型全基因组关联分析及基因候选

2025-04-27 00:36200下载
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文件大小:1.19M

  摘要:水稻粒型与水稻产量和品质息息相关,为挖掘调控水稻粒型相关基因,以139份西北早粳稻核心种质资源为材料,结合255 501个多态性SNPs,进行全基因组关联分析。结果表明:粒长仅在水稻7号染色体关联到显著QTL;长宽比在除2、4号染色体之外的10条染色体上均关联到显著QTL。通过基因注释和单倍型分析,将LOC_Os07g07130、LOC_Os10g03360和LOC_Os10g03390,3个预测基因列为影响水稻粒型的候选基因。

  文章目录

  1 材料与方法

  1.1 供试材料

  1.2 种植模式及水稻粒型鉴定

  1.3 数据分析

  2 结果与分析

  2.1 水稻粒型参数统计

  2.2 聚类分析

  2.3 相关性分析

  2.4 全基因组关联分析

  2.5 基因的候选

  2.5.1 粒长相关基因的候选

  2.5.2 长宽比基因的候选

  3讨论与结论



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