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摘要：分析患传染性脾肾坏死病毒（infectious spleen and kidney necrosis virus，ISKNV）疾病的配合饲料养殖翘嘴鳜（Siniperca chuatsi）池塘水质及微生物群落结构特征，可为理解ISKNV暴发后池塘水质及菌群结构的动态变化提供参考。测定ISKNV暴发前后的池塘水质指标，并采用16S rDNA测序技术分析池塘水体微生物群落结构。结果表明：ISKNV暴发后，池塘水体碱度、氨氮、硝酸盐氮、总氮和总磷积累率升高；ISKNV暴发后，池塘自净能力降低，水体菌群结构改变；在翘嘴鳜养殖池塘水体中，主要优势菌门为变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）等；ISKNV暴发后，池塘水体微生物丰富度和多样性下降，变形菌门的相对丰度降低，作为污染指示菌的拟杆菌门相对丰度增加，热单胞菌属（Thermomonas）、芽殖杆菌属（Gemmobacter）和军团菌属（Legionella）等菌属相对丰度显著增加。
文章目录
1 材料与方法
1.1 样品采集
1.2 水质测定
1.3 Illumina高通量测序
1.4 Illumina HiSeq测序数据处理
1.5 数据分析
2 结果与分析
2.1 ISKNV暴发后池塘水体理化因子
2.2 16S rDNA基因高通量测序
2.2.1 α多样性分析
2.2.1.1 稀释曲线
2.2.1.2 α-多样性指数
2.2.2 β-多样性分析
2.2.3 微生物群落组成
2.2.3.1门水平微生物群落结构
2.2.3.2属水平水体微生物群落结构
2.2.4差异菌群分析
2.3 主要菌属与理化指标的Pearson关联
3讨论
3.1 ISKN爆发后翘嘴鳜养殖池塘水体理化因子变化
3.2 ISKN爆发后翘嘴鳜养殖池塘水体微生物多样性和丰富度变化
3.3 ISKN爆发后翘嘴鳜养殖池塘水体微生物群落结构变化
3.4 微生物和水质参数关联分析
4 结论
